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3CDB是一个染色质空间互作的数据库，根据特定的关键词从pubmed数据库中进行文献检索，查找基于3C技术研究染色质互作的文献，并从中提取染色质互作信息。
数据库网址如下
http://3cdb.big.ac.cn/index.jsp
收录了来自17个物种，共3319个染色质片段互作信息。不同物种数据量分布如下
3C实验涉及到的DNA内切酶分布如下
通过首页的Data Browser菜单，可以从以下四个方面浏览该数据库中的内容
Species
Cell line
Enzyme
Gene
以物种为例，界面如下所示
点击物种对应的Locus, 可以查看具体的互作信息列表，结果示意如下
点击第一列的编号，可以查看详细信息，示意如下
给出了对应的细胞系，内切酶，引物，文献等详细信息。该数据库中的信息是可以免费下载的，链接如下
http://3cdb.big.ac.cn/pages/download.jsp
通过该数据库，可以获得高可信度的染色质互作信息。
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